Nucleic&#160;Acids&#160;Research：同济大学王晨飞团队开发空间转录组分析算法 - 新闻频道

Nucleic Acids Research：同济大学王晨飞团队开发空间转录组分析算法

2022-03-12 18:00:50 来源：今日健康网作者：分享：

近些年，高通量单细胞测序技术的发展，使得研究人员能够在单细胞分辨率研究复杂生物系统中细胞的异质性，但在实验过程中需要经历组织消化等操作，导致细胞在组织中原始位置信息的丢失。新兴的空间转录组学技术则在定量基因表达水平的同时，保留了细胞的空间信息，研究人员得以在空间背景下研究细胞不同的功能状态以及细胞间的相互作用。然而，由于技术的限制，目前大多数空间转录组或是检

近些年，高通量单细胞测序技术的发展，使得研究人员能够在单细胞分辨率研究复杂生物系统中细胞的异质性，但在实验过程中需要经历组织消化等操作，导致细胞在组织中原始位置信息的丢失。新兴的空间转录组学技术则在定量基因表达水平的同时，保留了细胞的空间信息，研究人员得以在空间背景下研究细胞不同的功能状态以及细胞间的相互作用。然而，由于技术的限制，目前大多数空间转录组或是检测的基因数目较少，或是无法达到单细胞的分辨率，这些都为空间转录组的高精度分析带来了巨大的挑战。
近日，同济大学王晨飞课题组在 Nucleic Acids Research 期刊发表了题为：STRIDE： accurately decomposing and integrating spatial transcriptomics using single-cell RNA sequencing 的研究论文。
该研究开发了空间转录组与单细胞整合分析工具